Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Myod1P10085 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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