Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms