Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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