Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa6P09092 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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