Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc8P09025 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms