Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefmP08553 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefmP08553 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefmP08553 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefmP08553 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefmP08553 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefmP08553 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms