Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf3P05524 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms