Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tk1P04184 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tk1P04184 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms