Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt1P04104 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms