Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01656 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01656 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01656 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01656 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01656 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01656 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01656 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms