Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01654 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01654 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01654 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01654 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01654 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01654 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01654 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01654 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01654 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms