Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifnb1P01575 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms