Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp8O89110 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms