Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sypl2O89104 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sypl2O89104 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms