Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcn2O88968 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcn2O88968 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms