Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns1O88456 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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