Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tulp3O88413 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tulp3O88413 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms