Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms