Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms