Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nid2O88322 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nid2O88322 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid2O88322 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nid2O88322 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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