Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx1O70263 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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