Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox6O70238 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms