Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna4O70174 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms