Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms