Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms