Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms