Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms