Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BckdkO55028 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdkO55028 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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