Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms