Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms