Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LatO54957 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LatO54957 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LatO54957 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LatO54957 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LatO54957 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms