Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs5O54928 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs5O54928 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms