Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms