Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zmat3O54836 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat3O54836 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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