Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms