Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FxnO35943 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FxnO35943 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FxnO35943 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FxnO35943 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FxnO35943 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FxnO35943 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FxnO35943 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FxnO35943 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FxnO35943 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FxnO35943 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FxnO35943 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FxnO35943 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FxnO35943 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FxnO35943 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms