Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nek2O35942 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek2O35942 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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