Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms