Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn6O35646 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms