Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Opn1mwO35599 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Opn1mwO35599 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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