Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk4O35493 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms