Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf5O35445 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf5O35445 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf5O35445 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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