Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xbp1O35426 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms