Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn1O35350 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn1O35350 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms