Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkd2O35245 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms