Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd4O35226 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd4O35226 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms