Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms