Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcns1O35173 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcns1O35173 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcns1O35173 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms