Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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