Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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